Янаки Стоилов е преподавател в ЮФ на СУ „Св. Кл. Охридски”. Води лекционни курсове по обща теория на държавата, политология и обща теория на правото. Почетен професор е на университета Джао Тонг в Шанхай. Автор е на монографията „Държавната власт: правно-политически разграничения и съотношения” и на десетки статии по проблеми на правото, държавата и политиката. Редица години е бил народен представител и член на Парламентарната асамблея на Съвета на Европа. Като народен представител в VІІ-то Велико народно събрание активно участва в изработването и приемането на Конституцията на Република България.